Western 免疫印迹(Western Blot)是将蛋白质转移到膜上,然后利用抗体进行检测的实验。在WB 实验中常会出现各种问题,而拖慢实验速度,使实验达不到理想的效果。今天百萤跟各位同学一起分享下 WB 实验中各种问题及问题建议。
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 常见问题  | 
 可能原因  | 
 建议  | 
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 电泳条带成笑脸状  | 
 胶不均匀冷切,中间冷却不好,电泳系统温度偏高  | 
 减少电压减慢电泳速度,在冷室或者冰浴中进行电泳  | 
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 电泳条带成皱眉状  | 
 可能是由于装置不合适,特别可能是凝胶和玻璃挡板底部有气泡,或者两边聚合不完全  | 
 调整装置  | 
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 拖尾  | 
 样品溶解不好  | 
 样品充分溶解混匀后上样  | 
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 纹理(纵向条纹)  | 
 样品中含有不溶性颗粒  | 
 样品充分搅拌混匀  | 
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 条带偏斜  | 
 电极不平衡或者加样位置偏斜  | 
 调整电极和加样  | 
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 条带两边扩散  | 
 加样量过多  | 
 适当减少上样量  | 
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 Marker 变黑色  | 
 抗体和 Marker 蛋白反应  | 
 在 Marker 和 sample 之间空出一个孔不上样  | 
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 背景高  | 
 膜封闭不够  | 
 延长封闭时间,选择适宜的抗体稀释度  | 
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 一抗稀释度不适宜  | 
 对抗体进行滴度测试,选择适宜的抗体稀释度  | 
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 一抗孵育的温度偏高  | 
 建议 4℃ 结合过夜  | 
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 二抗浓度度过高  | 
 降低二抗浓度  | 
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 二抗的非特异性背景  | 
 增加一个二抗对照,不加一抗,其他操作过程不变,即可验证背景是否是由于二抗所致。可选择其它二抗(特异性更强的,只针对重链)  | 
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 二抗孵育时间过久  | 
 减少二抗孵育时间  | 
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 选择膜的问题  | 
 硝酸纤维素的背景会比 PVDF 膜低  | 
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 膜在实验过程中干过  | 
 实验过程中要注意保持膜的湿润  | 
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 检测时曝光时间过长  | 
 注意曝光时间的缩短  | 
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 洗膜不充分  | 
 增加洗膜的时间和次数  | 
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 抗体和封闭蛋白有交叉反应  | 
 检测抗体与封闭蛋白的交叉反应性,选择无交叉反应的封闭剂。洗涤液中加入 Tween-20 可减少交叉反应  | 
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 杂带较多  | 
 目的蛋白有多个修饰位点(磷酸化位点,糖基化位点,乙酰化位点等),本身可以呈现多条带  | 
 查阅文献或进行生物信息学分析,获得蛋白序列的修饰位点信息,通过去修饰确定蛋白试剂大小  | 
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 目的蛋白有其他剪切本  | 
 查阅文献或生物信息学分析可能性  | 
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 样品处理过程中目的蛋白发生降解  | 
 裂解液中加入蛋白酶抑制剂,样品处理在冰上进行  | 
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 上样量过高,太敏感  | 
 适当减少上样量  | 
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 一抗不纯  | 
 纯化抗体  | 
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 一抗特异性不高  | 
 重新选择或制备高特异性的抗体  | 
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 二抗的非特异性结合  | 
 增加一个二抗对照,不加一抗,其他操作过程不变,即可验证背景是否是由于二抗所致。可选择其它二抗(特异性更强的,只针对重链)  | 
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 一抗或二抗浓度偏高  | 
 降低抗体浓度  | 
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 细胞传代较多,导致蛋白变异  | 
 使用原代或传代少的细胞作对照  | 
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 蛋白条带位置 (大小)不对  | 
 二聚体或多聚体存在  | 
 增加蛋白质变性过程及强度  | 
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 翻译后剪切  | 
 比如很多蛋白是以前体蛋白的形式合成的,在执行功能时需要进行剪切成活化的形式  | 
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 相对电荷  | 
 氨基酸电荷的组成  | 
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 蛋白修饰  | 
 比如糖基化、磷酸化等修饰状态会导致蛋白分子量增加  | 
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 胶浓度  | 
 不同浓度的胶跑出的蛋白条带的位置可能有所偏差  | 
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 无蛋白条带  | 
 抗体孵育不充分  | 
 增加抗体浓度,延长孵育时间  | 
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 酶失活  | 
 直接将酶和底物进行混合,如果不显色则说明酶失活了。选择在有效期内、有活性的酶联物  | 
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 标本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太低  | 
 设置阳性对照,如果阳性对照有结果,但标本没有则可能是标本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太低。可考虑增加标本上样量解决靶蛋白含量低的原因  | 
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 试剂之间不匹配  | 
 一抗与组织种属,一抗与二抗或/和底物与酶系统之间不匹配。通过设置内参照可以验证二级检测系统的有效性  | 
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 一抗失效  | 
 选择在有效期内抗体,幷选择现配现用的工作液  | 
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 HRP 抑制剂  | 
 所用溶液和容器内避免含有叠氮化钠  | 
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 抗体不能识别测试种属的相关蛋白  | 
 购买抗体前应认真阅读抗体说明书,确定其是否能够交叉识别测试种属的对应蛋白  | 
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 二抗与一抗不匹配  | 
 选择针对一抗来源种属的抗体  | 
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 蛋白条带信号弱  | 
 抗体孵育不充分  | 
 增加抗体浓度,延长孵育时间  | 
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 酶活性降低  | 
 直接将酶和底物进行混合,如果不显色则说明酶失活了。选择在有效期内、有活性的酶联物  | 
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 洗膜过度  | 
 洗膜时间不宜过长,加入的去垢剂不宜过强或过多,建议使用 0.1% 的弱去垢剂 Tween-20  | 
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 标本中靶蛋白含量太低  | 
 增加样本上样量  | 
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 抗体活性降低  | 
 选择有效期内的抗体,工作液现配现用,避免长时间放置  | 
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 蛋白转移不充分  | 
 可以用丽春红染膜幷结合染胶(考马斯蓝)后确定条带是否转移到膜上或转移过度,适当调整转膜的时间和电流  | 
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 封闭过度  | 
 减少封闭剂的量或缩短时间,换用不同封闭剂类型  | 
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 曝光时间过短  | 
 延长曝光时间  | 
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 HRP 抑制剂  | 
 所用溶液和容器内避免含有叠氮化钠  | 
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 背景有黑色斑点  | 
 抗体与封闭试剂反应  | 
 使用前过滤封闭试剂  | 
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 HRP 偶联二抗中有聚集体  | 
 过滤二抗试剂,去除聚集体  | 
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 暗背景上白色带  | 
 HRP 含量过高  | 
 降低酶联二抗的浓度  | 
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 背景有不均匀的白色斑点  | 
 转膜过程中有气泡存在  | 
 仔细检测,避免存在气泡  | 
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 抗体分布不均匀  | 
 孵育抗体时使用摇床  | 
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